') ?> アンプリコンシークエンス/分子バーコード法 - 健康診断・血液検査MAP2

アンプリコンシークエンス/分子バーコード法

アンプリコンシークエンス法の1つですが、分子バーコード（unique molecular index:UMI）と呼ばれる目印（タグ）を核酸に付けることによって、アンプリコンシークエンス法の欠点を補ったものです

アンプリコンシークエンス/分子バーコード法

アンプリコンシークエンス/分子バーコード法は、アンプリコンシークエンス法の1つですが、分子バーコード（unique molecular index:UMI）と呼ばれる目印（タグ）を核酸に付けることによって、アンプリコンシークエンス法の欠点を補ったものです。タグが付いた信頼性の高いリードで変異の有無やCNVをみることができるため、エラーSNPやCNVにおける増幅効率の差といったものを補正することが容易となります。
非腫瘍部位検体が新鮮な血液由来のDNA、腫瘍部位検体が5年前のFFPE由来のDNAであっても、高感度にCNV解析を行うことが可能です。しかしながら、この方法も、極端に核酸分解が進行したFFPE由来の低品質DNA検体の場合はUIMが付加されないため、信頼できるリード数が減少します。

▽アンプリコンシークエンス/分子バーコード法 のキーワード

▽次の記事、前の記事

キャプチャーシークエンス法 | 次世代シーケンサー　ライブラリー

遺伝子関連カテゴリのRSS　 遺伝子関連 Atom (Atom) 遺伝子関連 RSS 2.0 (RSS 2.0)

健康診断・血液検査MAP2:新着記事

鉄のホメオスタシス
生体は鉄過剰や鉄欠乏に陥らないように複数のステップで鉄の取り込みを制御しています。
続発性鉄過剰症と鉄の毒性
蓄積した鉄により生じた活性酸素種（reactive oxygen species:ROS）が肝細胞障害や変異原生塩基の生成を惹起することが知られています。
単球由来マイクロパーティクル
膜小胞体は細胞の内部顆粒や膜性微粒子、および機械的破壊によって生成された膜のフラグメントを含み、マイクロパーティクル（microparticle:MP）と呼ばれています
My Nightingale マイ ナイチンゲール総合的健康状態把握
バイオマーカー測定値より算出される総合健康指標および各種健康指標
新型コロナ経口薬パキロビッドパック（Pfzer社）を特例承認
厚生労働省はファイザーが申請した「パキロビッドパック」（ニルマトレルビル・リトナビル）を新型コロナウイルス感染症（COVID-19）治療薬として特例承認しました
尿中コルチゾール
コルチゾールは、下垂体から分泌されるACTHの刺激を受けて、副腎皮質束状層より分泌される分子量362.5の糖質コルチコイドでACTHとの間にフィードバック関係があります
新型コロナウイルスCOVID-19のサイトカインストーム
「サイトカインストーム」は、何らかの原因によりIL-1β、IL-6、TNF-αなどの血中サイトカインの大量産生状態と、続発する全身の炎症状態を伴う過剰な免疫反応を表す言葉です
sFlt-1/PlGF比　妊婦高血圧腎症発症予測
PEの病態形成には、血管新生因子である胎盤増殖因子（PlGF）およびその阻害因子の可溶性fms様チロシンキナーゼ1（sFlt-1）が関与していることが明らかになっています
ctDNAの量と検査方法
血漿DNAの量は10ng/mL以下と微量であり、このうち腫瘍由来のctDNAは通常0.1〜1％の低頻度で含まれています
cfDNAとctDNA
cell-freeDNA（cf-DNA）は体内の細胞が死滅する際に、ゲノムDNAが細胞外に放出され血液中に短く断片化した遊離DNAです

Valid XHTML 1.0 Transitional Valid CSS! Lint