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キャプチャーシークエンス法は、アンプリコンシークエンス法における欠点を補完した手法であり、目的の遺伝子領域に特異的なプローブをハイブリダイゼーションさせることで、標的遺伝子を濃縮します。つまり、サンプル中に含まれるDNAやRNAの解析したい領域を、全てハイブリダイゼーションで抽出するということです。
したがって、アンプリコンシークエンス法でみられるような検体品質の差によるPCR差が現れないため、非常に高感度にCNV解析ができます。
ただし、アンプリコンシークエンス法よりも高い核酸品質が必要であり、ハイブリダイズできる品質の核酸でなければ、キャプチャーシークエンス法は成立しません。
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